對於政大教授要發起反對獨尊SSCI與SCI的連署，教育部高教司長何卓飛表示，新階段的頂尖大學計畫將不再獨尊SSCI 與SCI，尤其是人文與社會科學領域，專書的發表將列為重要指標；另外，也樂見學者提出更具公信力的人文指標，供教育部參考。

何卓飛坦言，過去台灣確實有獨尊SSCI與SCI的現象，造成人文與社會領域在論文的表現上明顯輸給自然科學領域，但經過學者不斷建議後，教育部已經修正，包括大學評鑑與頂尖大學計畫，人文學者最重要的評分將以「專書」取代論文數，即使仍有SSCI與SCI論文數，但已無舉足輕重的影響。

至於今年國家講座人文與社會學科都從缺，總統馬英九今天致詞時也表示感到遺憾，教育部次長林聰明坦言，原本有幾位入圍的教授，但送給國外院士級專家學者審查時，沒有獲選，因此今年的國家講座當中，人文與社會學科都從缺。